3.5 asır Hollandalı sömürgeciler tarafından sömürgeleştirilmesi sonucunda dünya böylesine uzun bir karanlık dönem yaşadı. Ancak bu kolonyal dönemin uzunluğu direnişsiz değildi. Çünkü birkaç bölge, biri Diponegoro Savaşı olan büyük liderlerin önderliğinde savaştı.
Java Savaşı olarak da bilinen Diponegoro Savaşı büyük bir savaştı ve Java adasında 1825-1830 yılları arasında 5 yıl sürdü. Bu savaş, Hollandalıların takımadaları işgali sırasında yaşadığı en büyük savaşlardan biriydi.
Sonuç olarak, yaklaşık 200 bin Cava savaşçısı öldürüldü ve Hollanda kalesinde yaklaşık 8000 Hollandalı asker öldürüldü. Adından da anlaşılacağı gibi, bu savaşa saray, ulema ve Yogyakarta halkı tarafından desteklenen Prens Diponegoro önderlik etti. Cava Sarayı ile Hollandalılar arasındaki çekişme, Mareşal Herman Willem Daendels'in 5 Ocak 1808'de Batavia'ya gelmesiyle başladı.
Diponegoro Savaşının nedenlerinden biri, Pangeran Diponegoro'nun Tegalrejo'daki atalarının topraklarının mezarından izinsiz geçen bir yolun inşası için bir kazık kuran Hollandalıların eylemiydi. Bu yüzden Pangeran Diponegoro kazığı bir mızrakla değiştirdi, bu da Hollandalıları kızdırdı ve Pangeran Diponegoro'nun isyan ettiğini düşünerek onu tutuklamayı planladı.
(Ayrıca okuyun: Padri Savaşı Hakkında Bilgi Edinin)
Bu tabii ki halk tarafından kabul edilmedi, bu yüzden Hollanda'ya savaş ilan ettiler. Pangeran Diponegoro, Hollandalı askerlerle ilişkilerinde aldatma, yıldırım saldırıları ve görünmez kuşatma uygulayarak gerilla taktikleri kullandı. O zamanlar De Kock liderliğindeki Hollandalı birlikler, dünyanın taktikleriyle yüzleşirken, Fort Stelsel taktiğini, yani iletişim ve birlik hareketlerinin sorunsuz ilerleyebilmesi için kontrolleri altındaki her bölgede yollarla birbirine bağlanan bir kale kurarak kullandılar.
Bu kale sistemi Diponegoro'nun birliklerini sabit tuttu, böylece 1829'da isyanın ruhani lideri Kyai Mojo tutuklandı. Bunun ardından Prens Mangkubumi ve komutanı Alibasah Sentot Prawirodirjo, Hollandalılara teslim oldu. Sonunda, 28 Mart 1830'da General De Kock, Diponegoro'nun birliklerini Magelang'da tutmayı başardı ve Pangeran Diponegoro, ordusunun geri kalan üyelerinin serbest bırakılması şartıyla teslim oldu.
Pangeran Diponegoro teslim olduktan sonra Manado'ya sürüldü ve 8 Ocak 1855'te Fort Rotterdam'da ölünceye kadar Makassar'a geri döndü. Cava Savaşı'nın sonu, Cava aristokrat direnişinin sonu oldu ve savaş sona erdikten sonra Yogyakarta nüfusu yarı yarıya azaldı.
